绝大多数针灸师只能够采用传统的针灸理论来进行取穴治疗。对有些疾病，传统的针灸理论也有它的局限性，治疗效果不理想。根据不同情况，刘琴博士采用下列4种理论进行取穴, 确保疗效。
一,采用传统的针灸理论
传统的针灸理论是治疗下列疾病的常规方法
1.神经、精神系统疾病
中风及其合并症、脑瘫、运动神经元疾病、周围神经损伤、截瘫、脊髓炎、神经根炎、三叉神经痛、坐骨神经痛、臂丛神经痛、头痛、多发性硬化症、老年性震颤麻痹、各类神经痛、失眠、抑郁症、焦虑症、周期性麻痹、面瘫、面肌痉挛、耳聋耳鸣。
2.循环、呼吸系统疾病
大动脉炎、病窦综合征、心律失常、心肌缺血、高血压、低血压、高血脂、椎基底动脉供血不足、雷诺氏病、深部静脉炎、哮喘、过敏性鼻炎。
3.消化系统疾病
胃下垂、胃炎、消化系统溃疡、呃逆、胃肠神经官能症、结肠炎、便秘、胆囊炎、胆石症。
4.泌尿、生殖系统疾病
前列腺疾患、男子不育、女子不孕、泌尿系结石、阳痿、早泻、性功能低下、遗尿、尿失禁、尿潴留。
5.内分泌系统疾病
更年期综合征。
6.骨关节疾病
颈腰椎脊柱关节病、肩周炎、强直性脊柱炎、网球肘、关节炎、急性软组织扭伤。
7.代谢性疾病
痛风、糖尿病。
8.妇科疾病
月经不调、痛经、子宫肌瘤、卵巢囊肿。
9.外科疾病
丹毒、乳腺增生、乳腺炎（乳痈）、带状疱疹。
10.其它
戒烟、减肥、疲劳综合征。
二，经筋疗法
1, 经筋疗法简介
经筋，即人体筋肉系统，包括肌肉、肌腱、筋膜、韧带等软组织结构。经筋疗法是以软组织病变形成的筋结病灶为治疗点，采用不同针灸手法，以治疗各种疾病的新方法。
2, 经筋疗法优点
安全稳当，见效快，往往针到痛止，比吃药来得快。
3, 经筋疗法临床应用
1)，经筋性疾患：肌性、筋性、韧带等疾病，如急慢性软组织损伤，进行性肌营养不良，进行性肌萎缩等；
2)，功能性疾患合并经筋病者，如神经官能症、疲劳综合征、睡眠紊乱症、胃神经官能症、心脏神经症等；
3)，器质病变合并伤筋患者，如表浅性胃窦炎、慢性腹泻、慢性腹痛、腹胀、慢性消耗性疾病等；
4)，外感性疾患，如外感痧症、外感性肝郁证、外感风热证等。
5)，头痛、胃痛、风湿痹痛、关节痛、三叉神经痛、坐骨神经痛、各类神经痛、肩背痛、带状疱疹痛等。
三, 刺神经阻滞疗法
1, 刺神经阻滞疗法简介
以神经解剖理论为基础，结合针刺技术以治疗疼痛的方法，称之为针刺神经阻滞。刺神经阻滞疗法是刘琴博士在长期的临床和科研中总结，首次提出并应用于临床的最新针灸理论。
2, 针刺神经阻滞疗法优点:
1)，神经阻滞在疼痛治疗中效果确切，见效快，并发症少，有其突出优点；
2), 它不仅是症状治疗，而且也是病因治疗；
3)，适应证广，某些非疼痛行疾病过敏性鼻炎，面神经麻痹均可采用；
4)，具有正确诊断疼痛病因或判定预后的价值，尤其适用于定形性诊断方法难以作出确诊的疼痛。
3, 针刺神经阻滞疗法临床应用：
1)，神经痛：神经炎，坐骨神经痛，带状疱疹，臂丛神经损伤等;
2), 运动系统：颈椎病，腰椎间盘脱出等软组织损伤等;
3), 内脏痛：心绞痛，胃溃疡，肝炎等;
4), 植物神经痛：血管炎，动脉病变等;
5), 癌性痛;
6), 创伤痛：手术，外伤等.
四,腹针疗法
1, 腹针疗法 简介
腹针疗法是以神阙经络系统为核心，脏腑经络学说为指导在临床上具有广泛适应证的一种新的针灸疗法。
腹针直接在腹部施术治疗内脏疾病或久病及里的慢性全身性疾病，具有脏腑最集中，经脉最多,途径最短等优点。是一种最直接、最理想的刺激方法。
2, 腹针优点:
1), 腹针几乎无痛，解决了传统针灸因痛苦而不易被人接受的问题;
2), 腹针疗法疗效好而且作用快捷;
3), 腹针疗法对慢性病有显著疗效,
3, 腹针的临床应用
腹针的适应证：腹针的适应证为内因性疾病，即内伤性疾病功久病及里的疑难病、慢性病为主的适应证。临床上大致可以分为：
1)，病程较久的内伤脏腑的全身性疾病如：脑血管病后遗症、老年性痴呆、脑动脉硬化、心血管病、高血压、癔病等;
2)，脏腑失衡后引起的疾病如：血栓性耳聋、眼底出血、球后视神经炎、视神经萎缩等;
3)，虽病程较短，但与脏腑的正气不足相关的疾病如：肩周炎，症、坐骨神经痛、关节炎、颈椎综合症、腰痛、双腿麻木、酸困等;
4)，其他的针灸适应证，经治疗疗效不佳者，均可为腹针的适应证。